MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880102

Total Repeats: 585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011723	TAT	2	6	585	590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203934
2	NC_011723	TCTT	2	8	678	685	0 %	75 %	0 %	25 %	218203934
3	NC_011723	AAC	2	6	687	692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203934
4	NC_011723	CAA	2	6	725	730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203934
5	NC_011723	GAT	2	6	742	747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203934
6	NC_011723	TCTT	2	8	760	767	0 %	75 %	0 %	25 %	218203934
7	NC_011723	CTT	2	6	789	794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203934
8	NC_011723	T	6	6	798	803	0 %	100 %	0 %	0 %	218203934
9	NC_011723	TTTGA	2	10	813	822	20 %	60 %	20 %	0 %	218203934
10	NC_011723	TTG	2	6	858	863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203934
11	NC_011723	GAC	2	6	887	892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203934
12	NC_011723	TAC	2	6	930	935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203934
13	NC_011723	T	6	6	976	981	0 %	100 %	0 %	0 %	218203934
14	NC_011723	TGC	2	6	994	999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203934
15	NC_011723	AAT	2	6	1007	1012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203934
16	NC_011723	T	8	8	1014	1021	0 %	100 %	0 %	0 %	218203934
17	NC_011723	CAAT	2	8	1070	1077	50 %	25 %	0 %	25 %	218203934
18	NC_011723	TCT	4	12	1108	1119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203934
19	NC_011723	T	6	6	1126	1131	0 %	100 %	0 %	0 %	218203934
20	NC_011723	AGC	2	6	1225	1230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203934
21	NC_011723	TAT	2	6	1250	1255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203934
22	NC_011723	TTC	3	9	1287	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203934
23	NC_011723	T	6	6	1355	1360	0 %	100 %	0 %	0 %	218203934
24	NC_011723	CAAT	2	8	1394	1401	50 %	25 %	0 %	25 %	218203934
25	NC_011723	TTG	2	6	1410	1415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203934
26	NC_011723	TAA	2	6	1428	1433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203934
27	NC_011723	TGTT	2	8	1440	1447	0 %	75 %	25 %	0 %	218203934
28	NC_011723	ACA	2	6	3632	3637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203935
29	NC_011723	AAC	2	6	3665	3670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203935
30	NC_011723	CAT	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203935
31	NC_011723	TGA	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203936
32	NC_011723	TGT	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203936
33	NC_011723	GTT	2	6	3903	3908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203936
34	NC_011723	TCA	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203936
35	NC_011723	TGC	2	6	3963	3968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203936
36	NC_011723	TCA	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203936
37	NC_011723	ATG	2	6	3993	3998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203936
38	NC_011723	TAA	2	6	3999	4004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203936
39	NC_011723	CAA	2	6	4007	4012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
40	NC_011723	CTG	3	9	4052	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203936
41	NC_011723	GA	3	6	4092	4097	50 %	0 %	50 %	0 %	218203936
42	NC_011723	ACA	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
43	NC_011723	AAC	2	6	4176	4181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
44	NC_011723	GTT	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203936
45	NC_011723	TGA	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203936
46	NC_011723	TCA	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203936
47	NC_011723	AAC	2	6	4458	4463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
48	NC_011723	CAA	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203936
49	NC_011723	A	6	6	4495	4500	100 %	0 %	0 %	0 %	218203936
50	NC_011723	GCA	2	6	4537	4542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203936
51	NC_011723	TGTT	2	8	4665	4672	0 %	75 %	25 %	0 %	218203936
52	NC_011723	T	6	6	4832	4837	0 %	100 %	0 %	0 %	218203937
53	NC_011723	CTT	2	6	4840	4845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203937
54	NC_011723	CTC	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203937
55	NC_011723	TGC	2	6	4924	4929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203937
56	NC_011723	AAC	2	6	4991	4996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203937
57	NC_011723	CT	3	6	5002	5007	0 %	50 %	0 %	50 %	218203937
58	NC_011723	GAC	2	6	5102	5107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203937
59	NC_011723	AAC	2	6	5152	5157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203937
60	NC_011723	GAC	2	6	5159	5164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203937
61	NC_011723	GAA	2	6	5194	5199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203937
62	NC_011723	TTA	2	6	5220	5225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203937
63	NC_011723	C	6	6	5296	5301	0 %	0 %	0 %	100 %	218203937
64	NC_011723	ATT	2	6	5346	5351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203937
65	NC_011723	AGT	2	6	5365	5370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203937
66	NC_011723	GGC	2	6	5403	5408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218203937
67	NC_011723	TAC	2	6	5438	5443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203937
68	NC_011723	CGG	2	6	5532	5537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	218203937
69	NC_011723	ATC	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203937
70	NC_011723	GAT	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203937
71	NC_011723	TGC	2	6	5646	5651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203937
72	NC_011723	ATT	2	6	5712	5717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203937
73	NC_011723	AAG	2	6	5757	5762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203937
74	NC_011723	AGCC	2	8	5947	5954	25 %	0 %	25 %	50 %	218203937
75	NC_011723	ACA	2	6	6165	6170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203938
76	NC_011723	TTTA	2	8	6176	6183	25 %	75 %	0 %	0 %	218203938
77	NC_011723	CGA	2	6	6248	6253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203938
78	NC_011723	TCG	2	6	6305	6310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203938
79	NC_011723	AGC	2	6	6311	6316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203938
80	NC_011723	GGT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203938
81	NC_011723	TGC	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203938
82	NC_011723	GCC	2	6	6408	6413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	218203938
83	NC_011723	AAT	2	6	6527	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203938
84	NC_011723	TTG	2	6	6570	6575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203938
85	NC_011723	ACA	2	6	6588	6593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203938
86	NC_011723	AAT	2	6	6681	6686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203938
87	NC_011723	CAA	2	6	7407	7412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203939
88	NC_011723	TCT	2	6	7480	7485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
89	NC_011723	AT	3	6	7515	7520	50 %	50 %	0 %	0 %	218203939
90	NC_011723	TAA	2	6	7588	7593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
91	NC_011723	TCC	2	6	7645	7650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203939
92	NC_011723	TAA	2	6	7737	7742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
93	NC_011723	TTC	3	9	7750	7758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
94	NC_011723	TCT	2	6	7779	7784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
95	NC_011723	T	7	7	7838	7844	0 %	100 %	0 %	0 %	218203939
96	NC_011723	TTC	2	6	7895	7900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
97	NC_011723	CTT	2	6	7904	7909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
98	NC_011723	GTTTC	2	10	7969	7978	0 %	60 %	20 %	20 %	218203939
99	NC_011723	TAA	2	6	8029	8034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
100	NC_011723	AAT	2	6	8048	8053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
101	NC_011723	TGC	2	6	8094	8099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203939
102	NC_011723	T	6	6	8104	8109	0 %	100 %	0 %	0 %	218203939
103	NC_011723	CT	3	6	8139	8144	0 %	50 %	0 %	50 %	218203939
104	NC_011723	CTA	2	6	8241	8246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203939
105	NC_011723	ATA	2	6	8268	8273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203939
106	NC_011723	TCT	2	6	8313	8318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203939
107	NC_011723	AGGAAG	2	12	8341	8352	50 %	0 %	50 %	0 %	218203939
108	NC_011723	TTCTA	2	10	8368	8377	20 %	60 %	0 %	20 %	218203939
109	NC_011723	GTAAAA	2	12	8415	8426	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218203939
110	NC_011723	A	6	6	8474	8479	100 %	0 %	0 %	0 %	218203939
111	NC_011723	AAG	2	6	8833	8838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203940
112	NC_011723	TGCT	2	8	8857	8864	0 %	50 %	25 %	25 %	218203940
113	NC_011723	GAG	2	6	8877	8882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203940
114	NC_011723	GGTA	2	8	8929	8936	25 %	25 %	50 %	0 %	218203940
115	NC_011723	TCA	2	6	8981	8986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203940
116	NC_011723	ACC	2	6	8998	9003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203940
117	NC_011723	AAC	2	6	9004	9009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203940
118	NC_011723	TAAG	2	8	9103	9110	50 %	25 %	25 %	0 %	218203940
119	NC_011723	CAT	2	6	9129	9134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203940
120	NC_011723	CTT	2	6	9138	9143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203940
121	NC_011723	ATT	2	6	9160	9165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203940
122	NC_011723	AGC	3	9	9193	9201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203940
123	NC_011723	CAG	2	6	9264	9269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203940
124	NC_011723	GGT	2	6	9280	9285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	218203940
125	NC_011723	AAC	2	6	9286	9291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218203940
126	NC_011723	ATTTC	2	10	9294	9303	20 %	60 %	0 %	20 %	218203940
127	NC_011723	CAGAA	2	10	9384	9393	60 %	0 %	20 %	20 %	218203941
128	NC_011723	TCT	2	6	9445	9450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203941
129	NC_011723	ATA	2	6	9466	9471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203941
130	NC_011723	AGC	3	9	9519	9527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203941
131	NC_011723	GCAC	2	8	9550	9557	25 %	0 %	25 %	50 %	218203941
132	NC_011723	ATC	2	6	9618	9623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203941
133	NC_011723	AAGC	2	8	9691	9698	50 %	0 %	25 %	25 %	218203941
134	NC_011723	ACG	2	6	9705	9710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203941
135	NC_011723	CCA	2	6	9727	9732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203941
136	NC_011723	TCC	2	6	10249	10254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203942
137	NC_011723	TTAT	2	8	10450	10457	25 %	75 %	0 %	0 %	218203942
138	NC_011723	T	6	6	10496	10501	0 %	100 %	0 %	0 %	218203942
139	NC_011723	A	8	8	10514	10521	100 %	0 %	0 %	0 %	218203942
140	NC_011723	GTT	2	6	10527	10532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203942
141	NC_011723	ATT	2	6	10564	10569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203942
142	NC_011723	GAAAT	2	10	10635	10644	60 %	20 %	20 %	0 %	218203942
143	NC_011723	ACG	2	6	10648	10653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203942
144	NC_011723	TATT	2	8	10674	10681	25 %	75 %	0 %	0 %	218203942
145	NC_011723	TTA	2	6	10708	10713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203942
146	NC_011723	CCCAA	2	10	10774	10783	40 %	0 %	0 %	60 %	218203942
147	NC_011723	TTTG	2	8	10922	10929	0 %	75 %	25 %	0 %	218203942
148	NC_011723	AAT	2	6	10972	10977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203942
149	NC_011723	T	6	6	11060	11065	0 %	100 %	0 %	0 %	218203943
150	NC_011723	GA	3	6	11133	11138	50 %	0 %	50 %	0 %	218203943
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152	NC_011723	ACT	2	6	11184	11189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203943
153	NC_011723	GCT	2	6	11229	11234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203943
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155	NC_011723	T	6	6	11307	11312	0 %	100 %	0 %	0 %	218203943
156	NC_011723	CAG	2	6	11391	11396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203943
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158	NC_011723	G	7	7	11452	11458	0 %	0 %	100 %	0 %	218203943
159	NC_011723	AGA	2	6	11468	11473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218203943
160	NC_011723	CTTT	2	8	11482	11489	0 %	75 %	0 %	25 %	218203943
161	NC_011723	CTT	2	6	11498	11503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203943
162	NC_011723	GTA	2	6	11532	11537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203943
163	NC_011723	TCC	2	6	11635	11640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218203943
164	NC_011723	AATT	2	8	11882	11889	50 %	50 %	0 %	0 %	218203944
165	NC_011723	TCAGAT	2	12	11929	11940	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	218203944
166	NC_011723	TAC	2	6	11945	11950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203944
167	NC_011723	AGCA	2	8	11960	11967	50 %	0 %	25 %	25 %	218203944
168	NC_011723	GAT	2	6	11968	11973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203944
169	NC_011723	CTG	2	6	12038	12043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203944
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181	NC_011723	AACT	2	8	12755	12762	50 %	25 %	0 %	25 %	218203945
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232	NC_011723	TAA	2	6	17181	17186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203950
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239	NC_011723	ATTAA	2	10	17594	17603	60 %	40 %	0 %	0 %	218203950
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242	NC_011723	T	6	6	17933	17938	0 %	100 %	0 %	0 %	218203951
243	NC_011723	TAG	2	6	18095	18100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203951
244	NC_011723	ATC	2	6	18123	18128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203951
245	NC_011723	TAA	2	6	18209	18214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203951
246	NC_011723	AAT	2	6	18240	18245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203951
247	NC_011723	CTT	2	6	18263	18268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203951
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250	NC_011723	CCA	2	6	18793	18798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203952
251	NC_011723	CCA	2	6	18818	18823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203952
252	NC_011723	CTTG	2	8	18896	18903	0 %	50 %	25 %	25 %	218203952
253	NC_011723	ATA	2	6	18930	18935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218203952
254	NC_011723	CTG	2	6	18960	18965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203952
255	NC_011723	TCA	2	6	18970	18975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203952
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258	NC_011723	TTG	2	6	19478	19483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218203953
259	NC_011723	TTA	2	6	19512	19517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218203953
260	NC_011723	TAAA	2	8	19526	19533	75 %	25 %	0 %	0 %	218203953
261	NC_011723	CGA	2	6	19545	19550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218203953
262	NC_011723	CTT	2	6	19618	19623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203953
263	NC_011723	TGC	2	6	19693	19698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218203953
264	NC_011723	AGG	2	6	19706	19711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	218203953
265	NC_011723	CTA	2	6	19791	19796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218203953
266	NC_011723	CCA	2	6	19834	19839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218203953
267	NC_011723	GTA	2	6	19871	19876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218203953
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269	NC_011723	GA	3	6	20096	20101	50 %	0 %	50 %	0 %	218203953
270	NC_011723	CTT	2	6	20230	20235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203953
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289	NC_011723	TCAA	2	8	21497	21504	50 %	25 %	0 %	25 %	218203955
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294	NC_011723	CTT	2	6	21717	21722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218203955
295	NC_011723	CT	3	6	21790	21795	0 %	50 %	0 %	50 %	218203955
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